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Assistant(e) ingénieur en criblage cellulaire à haut-débit/métagénomique
Référence
1562941279
Date limite pour postuler
02/09/2019
Date de publication
12/07/2019

Caractéristiques

Précision sur la nature du contrat
Mission temporaire
Durée du contrat
12 mois renouvelable
Date de début de contrat
15/10/2019

Rémunération
2200 € pour 13 mois

Affectation

Nom de l'unité d'affectation
US1367 MGP MetaGénoPolis
Adresse de l'unité d'affectation
INRA Domaine de Vilvert 78352 JOUY-EN-JOSAS CEDEX
Région de l'unite d'affectation
Ile-de-France

Descriptif

Environnement de travail

L'activité s'exerce au sein de la plateforme MetaFun qui fait partie du démonstrateur préindustriel MetaGenoPolis (certifié ISO9001) financé dans le cadre des investissements d'avenir. Elle a pour vocation de développer et maintenir des outils performants et novateurs de métagénomique fonctionnelle appliquée à l'écosystème intestinal humain et de répondre aux demandes de la recherche académique et industrielle au niveau national et international. Son approche de métagénomique fonctionnelle vise à étudier les interactions entre le microbiote commensal et les cellules de l’hôte. Ainsi, elle a développé et utilise des méthodes de criblage cellulaire (systèmes de gènes rapporteurs fluorescents ou luminescents) à haut débit, afin d’identifier des gènes bactériens impliqués dans la modulation de la signalisation cellulaire.

MetaFun traite de façon intégrée l’ensemble des étapes de son approche de métagénomique fonctionnelle, depuis la production de banques génomiques/métagénomiques et de cribles cellulaires au criblage à haut débit automatisé de ces banques sur divers cribles cellulaires (par mesure d’activités cellulaires et imagerie cellulaire haut-débit (HCS)).

L'assistant(e)  ingénieur(e)  (AI) recruté(e) intégrera une équipe de 4 personnes et sera placé(e) sous la direction de la responsable opérationnelle de la plateforme. Il/elle travaillera en étroite intéraction avec les membres de l’équipe ainsi qu’en collaboration avec divers partenaires académiques et industriels porteurs de projets.

L’AI aura en charge l’atelier de criblage à haut débit et de production de banques.  Il/elle :

- développera, adaptera et mettra en œuvre des protocoles de criblage à haut débit et de production de banques métagénomiques ou génomiques.

- aura en charge les différentes étapes du criblage (préparation des cultures bactériennes et cellulaires, révélation d’activité de gènes rapporteurs …).

- analysera les données de criblages et de production de banques, et en présentera les résultats.

 - gérera les stocks de consommables et les moyens techniques alloués aux criblages et à la production de banque (stations de pipetages …). Il/elle assurera l’entretien et la réalisation de contrôles qualités des équipements, formera et encadrera les utilisateurs, et organisera et contrôlera l’utilisation collective des appareillages.

L'AI rédigera les documents qualités requis, appliquera et mettra en place divers outils de qualité et de traçabilité. Enfin, il/elle assurera une veille scientifique et technique.

Formations et compétences attendues

Compétences : 

-          des connaissances théoriques en biologie cellulaire, microbiologie et biologie moléculaire,

-          une expérience en biologie cellulaire et moléculaire et la maîtrise pratique de la culture cellulaire,

-          une expérience en culture bactérienne,

-          une expérience en robotique, programmation et imagerie cellulaire (HCS) serait un plus,

-          la maîtrise du pack Office Microsoft (Word, PowerPoint, Excel),

-          la capacité à communiquer clairement à l’oral et à l’écrit en français,

-          un anglais technique et scientifique,

-          un sens de l’organisation, une rigueur, une motivation, une capacité d’adaptation aux priorités, une polyvalence et des qualités relationnelles.

Formation recommandée : Diplôme exigé : Bac+2/+3 en biologie avec si possible une expérience professionnelle.

Contact

Nom
Armel Oulai
Email
armel.oulai@inra.fr